醫院始建于1953年5月，是由政府舉辦，不以營利為目的，具有公共衛生性質的非營利性公益一類全額撥款衛生事業單位，集預防、保健、臨床、急救、科研、教學于一體，屬二級甲等婦幼保健機構。前身為邵陽市婦幼保健所，有婦幼保健人員5人，主要負責市區內新法接生的宣傳，接生員的培訓與管理。

1958年以后數度整合：1986年地、市婦幼保健站（所）合并為邵陽市婦幼保健所；1994年升格為副處級事業單位，改稱邵陽市婦幼保健院。秉乘“母親安全，兒童優先”婦幼方針，擔負著全市12個縣（市、區）的婦幼健康服務、重大公共衛生項目、科研教學、基層技術指導、計劃生育服務等多項工作，為降低全市的孕產婦死亡率、五歲以下兒童死亡率和提高出生缺陷防控率做出了重大貢獻。

醫院按國家衛生計生委關于婦幼保健機構業務科室設置要求設立了“四部二中心”，即“婦女保健部、兒童保健部、孕產婦保健部、計劃生育部、醫學遺傳中心、新生兒疾病篩查中心”，圍繞婦女兒童全生命周期開展健康服務。現開設急診科、婦科、產科、婦女保健科、兒科、新生兒科、兒童保健科、兒童早教康復科、遺傳優生科、生殖醫學科、超聲影像科、病理科等科室。

開展婦女保健、不孕不育、兒童早教康復、產前篩查及診斷、新生兒疾病篩查、新生兒危急重癥診治、產后盆底康復、婦產科微創手術、宮頸疾病診治、病理檢驗等優質特色服務。設有邵陽市唯一一家經湖南省衛生計生委批準的產前診斷中心、新生兒疾病篩查中心。

同時作為我市唯一的出生缺陷防控中心，開展產前篩查與診斷、羊水穿刺染色體遺傳學檢查、新生兒疾病篩查、細胞染色體培養、無創DNA檢測、地中海貧血篩查與診斷、染色體微陣列（CMA）、遺傳咨詢與指導等，為出生缺陷防控提供了強有力的技術保障。