上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院由中華人民共和國教育部、中華人民共和國衛(wèi)生部和上海市人民政府共建，位列“211工程”、“985工程”、“雙一流”，入選中國首批“卓越醫(yī)生教育培養(yǎng)計(jì)劃”，是國家級臨床技能實(shí)驗(yàn)示范中心學(xué)科組長單位、上海市卓越醫(yī)學(xué)教育計(jì)劃專家組組長單位、全國法文醫(yī)學(xué)特藏中心。

上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院前身是由圣約翰大學(xué)醫(yī)學(xué)院（創(chuàng)建于1896年）、震旦大學(xué)醫(yī)學(xué)院（創(chuàng)建于1911年）、同德醫(yī)學(xué)院（創(chuàng)建于1918年）于1952年全國高等學(xué)校院系調(diào)整時(shí)合并而成的上海第二醫(yī)學(xué)院；1985年，更名為上海第二醫(yī)科大學(xué)。1997年，學(xué)校通過了“211工程”立項(xiàng)。2005年7月18日，上海交通大學(xué)與上海第二醫(yī)科大學(xué)合并，成立了由教育部、上海市人民政府重點(diǎn)共建的上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院，進(jìn)入“985”高校行列。2010年11月，學(xué)院成為衛(wèi)生部與教育部合作共建的第一批十個(gè)重點(diǎn)高校中的一員。

截至2017年12月底，學(xué)院擁有重慶南路、閔行兩個(gè)校區(qū)，下設(shè)23個(gè)學(xué)院（系），13所附屬醫(yī)院，開辦2個(gè)八年制專業(yè)（授予博士學(xué)位）和7個(gè)本科專業(yè)；有4個(gè)一級學(xué)科博士后流動站，8個(gè)一級學(xué)科博士學(xué)位授權(quán)點(diǎn)；有國家重點(diǎn)學(xué)科（三級學(xué)科）16個(gè)，上海市重點(diǎn)學(xué)科18個(gè)，上海高校一流學(xué)科9個(gè)；7個(gè)學(xué)科進(jìn)入ESI全球排名前1%；有教職醫(yī)務(wù)員工25348名，專任教師661名，院士31人；有在校生7927名，其中本科及長學(xué)制學(xué)生2821名，研究生4842名，留學(xué)生274名。