1948年與北方大學(xué)醫(yī)學(xué)院合編為華北醫(yī)科大學(xué)，1951年命名為中國人民解放軍第一軍醫(yī)大學(xué)，1959年更名為吉林醫(yī)科大學(xué)，1978年更名為白求恩醫(yī)科大學(xué)，2000年與原吉林大學(xué)、吉林工業(yè)大學(xué)，長春科技大學(xué)、長春郵電學(xué)院合并成為新的吉林大學(xué)。

合校以來，學(xué)校不斷探索和完善綜合性大學(xué)舉辦醫(yī)學(xué)教育的管理體制和運(yùn)行機(jī)制。2003年成立了白求恩醫(yī)學(xué)部，2007年成立了白求恩醫(yī)學(xué)院，增加了其對三個附屬醫(yī)院教學(xué)、學(xué)生管理等工作的統(tǒng)籌和協(xié)調(diào)職能。2012年，學(xué)校根據(jù)教育部《關(guān)于進(jìn)一步推進(jìn)教育部直屬高校醫(yī)學(xué)教育管理體制改革的意見》（教直〔2012〕1號）的文件精神，進(jìn)一步推進(jìn)醫(yī)學(xué)教育管理體制改革，賦予了白求恩醫(yī)學(xué)部實(shí)質(zhì)性的管理職能，由具有醫(yī)學(xué)背景的副校長兼任白求恩醫(yī)學(xué)部學(xué)部長，分管醫(yī)學(xué)教育工作。

學(xué)校黨委在醫(yī)學(xué)部設(shè)立了黨工委和紀(jì)工委，黨工委書記由學(xué)校黨委副書記兼任。學(xué)校對醫(yī)學(xué)教育履行統(tǒng)籌規(guī)劃、宏觀管理、資源投入和領(lǐng)導(dǎo)干部管理職責(zé)，學(xué)部機(jī)關(guān)設(shè)立綜合辦公室、醫(yī)院管理辦公室、人才培養(yǎng)辦公室、學(xué)術(shù)工作辦公室和學(xué)生工作辦公室五個管理部門，在學(xué)校統(tǒng)一領(lǐng)導(dǎo)下對醫(yī)學(xué)教育工作進(jìn)行統(tǒng)籌、協(xié)調(diào)和管理。

學(xué)部下設(shè)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院、公共衛(wèi)生學(xué)院、藥學(xué)院、護(hù)理學(xué)院、臨床醫(yī)學(xué)院、口腔醫(yī)學(xué)院6個學(xué)院和第一醫(yī)院（臨床醫(yī)學(xué)院第一學(xué)院）、第二醫(yī)院（臨床醫(yī)學(xué)院第二學(xué)院）、中日聯(lián)誼醫(yī)院（臨床醫(yī)學(xué)院第三學(xué)院）、口腔醫(yī)院（口腔醫(yī)學(xué)院）4所附屬醫(yī)院，以及1個再生醫(yī)學(xué)科學(xué)研究所（依托藥學(xué)院）。

全日制普通本科專業(yè)有臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)（五年制、5+3一體化）、口腔醫(yī)學(xué)專業(yè)（五年制、5+3一體化）、預(yù)防醫(yī)學(xué)專業(yè)、放射醫(yī)學(xué)專業(yè)、信息管理與信息系統(tǒng)專業(yè)（醫(yī)藥）、藥學(xué)專業(yè)、臨床藥學(xué)專業(yè)、生物工程專業(yè)、護(hù)理專業(yè)、康復(fù)治療學(xué)專業(yè)。共有在讀學(xué)生9881人，其中本科生（含四年制、五年制、5+3一體化）5185人、研究生4696人。擁有一級學(xué)科博士授權(quán)點(diǎn)7個，二級學(xué)科博士授權(quán)點(diǎn)58個，碩士授權(quán)點(diǎn)59個，博士后流動站6個。

現(xiàn)有在編職工7801人，其中教師1989人，教授583人，副教授799人；專業(yè)技術(shù)人員6299人(含附屬醫(yī)院醫(yī)療教師1534人)；聘用制人員11034人。博士生導(dǎo)師309人，碩士生導(dǎo)師1393人。中國工程院雙聘院士13人，國務(wù)院學(xué)位委員會學(xué)科評議組成員2人，海外高層次人才引進(jìn)計劃入選專家6人，“萬人計劃”入選者3人，國家教學(xué)名師1人，國家“973”計劃（含重大科學(xué)研究計劃）項目首席科學(xué)家2人，教育部“長江學(xué)者獎勵計劃”入選者2人，“長江學(xué)者和創(chuàng)新團(tuán)隊發(fā)展計劃”創(chuàng)新團(tuán)隊3個,國家優(yōu)秀青年基金獲得者2人，吉林省“長白山學(xué)者”入選13人，全國模范教師1人，國家優(yōu)秀教學(xué)團(tuán)隊1個，省級教學(xué)名師8人，吉林大學(xué)唐敖慶特聘教授6人。

學(xué)部緊緊圍繞國家“雙一流”的戰(zhàn)略決策，積極推動“人與動物共有醫(yī)學(xué)”交叉學(xué)科群的建設(shè)。現(xiàn)有二級學(xué)科國家重點(diǎn)學(xué)科1個，吉林省重中之重學(xué)科1個，吉林省優(yōu)勢特色重點(diǎn)學(xué)科6個。據(jù)基本科學(xué)指標(biāo)數(shù)據(jù)庫（ESI）公布的數(shù)據(jù)，截至2019年3月，臨床醫(yī)學(xué)、生物學(xué)與生物化學(xué)、分子生物學(xué)與遺傳學(xué)、藥理學(xué)和毒理學(xué)、免疫學(xué)5個醫(yī)學(xué)相關(guān)學(xué)科進(jìn)入世界學(xué)術(shù)機(jī)構(gòu)前1%。

現(xiàn)有國家地方聯(lián)合工程實(shí)驗室1個、教育部重點(diǎn)實(shí)驗室2個、衛(wèi)生部重點(diǎn)實(shí)驗室1個、科技部國際科技合作基地1個、國家中醫(yī)藥管理局三級實(shí)驗室7個，省級科研機(jī)構(gòu)143個，科研流動站16個。

現(xiàn)有國家級精品課4門，省級精品課16門，國家級教學(xué)成果獎4項，省部級教學(xué)成果獎86項。國家級實(shí)驗教學(xué)示范中心1個，國家級臨床教學(xué)培訓(xùn)示范中心1個。

現(xiàn)有集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、保健和康復(fù)于一體的附屬醫(yī)院4所，其中綜合醫(yī)院3所、口腔專科醫(yī)院1所，均為三級甲等醫(yī)院，綜合醫(yī)院還設(shè)有分部5個。附屬醫(yī)院總占地面積618342平方米，總建筑面積1053316平方米；床位數(shù)11800張；固定資產(chǎn)總價值66.31億元。設(shè)有200個臨床科室、48個醫(yī)技科室。2018年附屬醫(yī)院門診總量7606173人次，總出院病人數(shù)516943人次；手術(shù)量182966例。共有國家級臨床重點(diǎn)專科建設(shè)項目27個，吉林省醫(yī)療質(zhì)量控制中心17個。

學(xué)部始終重視對外交流與合作，已先后同日本、加拿大、美國、英國、瑞典、香港等近30個國家和地區(qū)的院校和學(xué)術(shù)團(tuán)體建立了長期的學(xué)術(shù)交流關(guān)系。在腫瘤學(xué)、婦幼衛(wèi)生與計劃生育、放射醫(yī)學(xué)、地方病學(xué)等方面，醫(yī)學(xué)部與世界衛(wèi)生組織、兒童基金會、國際原子能機(jī)構(gòu)等國際組織有著良好的合作關(guān)系。近年來，留學(xué)生教育工作也得到快速發(fā)展，學(xué)部以國際醫(yī)學(xué)教育標(biāo)準(zhǔn)和生源國衛(wèi)生執(zhí)業(yè)要求為導(dǎo)向，積極采取多項措施，不斷提升醫(yī)學(xué)留學(xué)生教學(xué)質(zhì)量。現(xiàn)有來自60個國家的本、碩、博及高級進(jìn)修生等各層次留學(xué)生636名，是吉林大學(xué)辦學(xué)規(guī)模最大的留學(xué)生教育學(xué)部，初步建成了全方位、多層次的醫(yī)學(xué)留學(xué)生培養(yǎng)格局。

白求恩醫(yī)學(xué)部將依托綜合性大學(xué)優(yōu)勢，著力加強(qiáng)人才培養(yǎng)、科學(xué)研究、學(xué)科建設(shè)和師資隊伍建設(shè)，提高醫(yī)療服務(wù)質(zhì)量和水平，繼承和發(fā)揚(yáng)白求恩優(yōu)良傳統(tǒng)，創(chuàng)造吉林大學(xué)醫(yī)學(xué)事業(yè)新的輝煌。